Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc18Q640L5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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Ccdc18Q640L5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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Ccdc18Q640L5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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Ccdc18Q640L5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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Ccdc18Q640L5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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Ccdc18Q640L5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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Ccdc18Q640L5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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Ccdc18Q640L5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc18Q640L5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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