Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnc3Q63959 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnc3Q63959 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnc3Q63959 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnc3Q63959 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnc3Q63959 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnc3Q63959 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnc3Q63959 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnc3Q63959 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnc3Q63959 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms