Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf260Q62513 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf260Q62513 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf260Q62513 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms