Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itga3Q62470 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga3Q62470 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms