Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vamp1Q62442 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp1Q62442 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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