Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TsnQ62348 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TsnQ62348 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TsnQ62348 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms