Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms