Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ifi47Q61635 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ifi47Q61635 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi47Q61635 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ifi47Q61635 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi47Q61635 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms