Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Erbb3Q61526 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb3Q61526 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms