Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itm2aQ61500 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms