Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1aQ61495 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1aQ61495 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms