Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcd1Q61466 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcd1Q61466 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms