Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne1Q61457 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne1Q61457 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms