Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcd2Q61285 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms