Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms