Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ift20Q61025 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms