Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lama5Q61001 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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