Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Klf3Q60980 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms