Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms