Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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DbpQ60925 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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DbpQ60925 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DbpQ60925 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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