Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmelQ60696 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmelQ60696 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmelQ60696 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms