Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms