Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thoc6Q5U4D9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms