Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bbs12Q5SUD9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms