Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sco1Q5SUC9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms