Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znrf3Q5SSZ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znrf3Q5SSZ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Znrf3Q5SSZ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Znrf3Q5SSZ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Znrf3Q5SSZ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Znrf3Q5SSZ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znrf3Q5SSZ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms