Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms