Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtp3Q5QGU6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms