Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RilpQ5ND29 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RilpQ5ND29 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms