Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms