Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Trim58Q5NCC9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim58Q5NCC9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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