Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms