Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xkr9Q5GH62 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms