Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prkaa1Q5EG47 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkaa1Q5EG47 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms