Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trp53i11Q4QQM4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Trp53i11Q4QQM4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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