Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms