Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Snx25Q3ZT31 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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