Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ulk4Q3V129 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms