Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms