Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Garnl3Q3V0G7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms