Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SvipQ3UZP4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms