Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E330034G19RikQ3UWX6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E330034G19RikQ3UWX6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms