Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim15Q3UTD9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms