Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BB287469Q3UT53 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms