Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6899Q3USS0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms