Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5460Q3UQ97 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm5460Q3UQ97 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5460Q3UQ97 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms