Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Shisa3Q3UPR0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Shisa3Q3UPR0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Shisa3Q3UPR0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa3Q3UPR0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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