Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec31aQ3UPL0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sec31aQ3UPL0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec31aQ3UPL0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec31aQ3UPL0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec31aQ3UPL0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec31aQ3UPL0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec31aQ3UPL0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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