Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UPC7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UPC7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UPC7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UPC7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UPC7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UPC7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UPC7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UPC7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UPC7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UPC7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UPC7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UPC7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms