Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms